同等學力申碩和在職研究生的主要區別就是：前者是一種報考方式，后者是一種教育形式，兩者屬于包含關系。國家在2016年取消了在職研究生，現在只有非全日制研究生，其定義、入學方式、報考時間等都是不同的。
一、兩者定義不同
1、同等學力申碩：
同等學力申碩又稱同力申碩，是在職人員以同等學力申請碩士學位的全國統考。其考試報名時間是在每年的3月份，登錄學位網報名，5月份參加考試。該考試科目有2門，滿分均為100分，只要每一門考到60分及以上就能通過考試。另外，若第一次沒有通過，也不用太過擔心，通常會有4次補考機會，通過率高，拿到碩士學位證的概率大。
2、在職研究生：
在職研究生是國家針對在職人員的身份，進行的繼續教育的一種類型。不會影響報考者的工作，反而還能提升他們的工作效率。同等學力申碩和非全日制研究生是常見的兩種在職研方式，所以同等學力申碩和在職研究生是包含的關系。
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二、同等學力和非全日制研究生區別
1、入學方式不同
同等學力：學員報考同等學力申碩，可免試入學。大家申請材料只要通過校內入學審核，就能成功進入院校讀研。
非全日制：報考非全日制的學員，需要先考試后入學?？忌蠄罂紬l件后，須參加聯考初試和院校復試，考試綜合成績達到國家及院校錄取分數線者，可順利入學。
2、所獲證書不同
同等學力：學員課程班學習結束，考生修完規定課程和學分，通過結業考試可取得結業證。結業證是學員完成校內學業的證明。符合申碩資格的考生通過申碩考試，完成畢業論文和答辯可取得碩士學位證書，提升自身學位。
非全日制：學員課程研修結束，修完規定課程，修夠學分，完成畢業論文和答辯可取得碩士學位證及研究生學歷證(即畢業證)，可提升學歷。
3、報考條件不同
同等學力：大專及以上學歷可報考課程班，本科有學士學位滿3年可申請碩士學位。
非全日制：?？飘厴I5年及以上，本科有無學位均可報考。
4、分數線不同
同等學力：每年分數線固定，60分/科目
非全日制：分為國家線、院校復試線，兩個分數線每年都不同，以當年的分數線為主。